现代发酵工程是以细胞的生长与代谢为核心，以生物技术改良、提高细胞产能，以工程技术保障细胞能发挥出最大的产能，从而实现生物制造的关键技术，处于产业的下游阶段。 发酵工程课程是在化工原理、微生物学和生物化学等课程的基础上，系统地介绍发酵过程中所需菌种的选育、培养基优化、放大培养与发酵动力学以及发酵控制等内容，具有涉及学科多、知识交融性与综合性强的特点。该课程是生物工程专业的专业核心课程，与《发酵工程实验》与《发酵工艺实训》课程共同完成对学生发酵知识、能力和素养的培养。